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不少丙肝患者在以往的治疗过程中，尝试过这样或那样的治疗方法，例如干扰素或各种中药。但是疗效不佳，治来治去，丙肝病毒RNA一直为阳性。遇到这种情况该怎么办呢? 衡量丙肝治疗效果好坏的标准，就是要看丙肝病毒RNA是否能够通过治疗转为阴性。丙肝治疗方案较为简单，就是干扰素联合病毒唑(利巴韦林)。以往治疗失败的病例主要原因，就是没有使用这种方法或是错误使用了这种方法。有些患者惧怕干扰素治疗，只采取一些中药或免疫调节剂治疗，既浪费了钱财，也耽误了病情；有的患者虽然采用了干扰素治疗，但是疗程不够，或是剂量不对，难以奏效；有的患者使用干扰素治疗时不联合使用病毒唑，也影响疗效。治疗丙肝要想获得最佳疗效，应从以下几个环节抓起：
1、干扰素是治疗丙肝的主打药物，必须首选。专家们一致认为，α干扰素是目前治疗丙肝惟一有效的药物。α干扰素包括普通α干扰素、复合干扰素和聚乙二醇α干扰素。聚乙二醇α干扰素就是所谓的长效干扰素，是目前公认治疗丙肝疗效最好的干扰素。如果丙肝患者经济条件许可，应该首先考虑使用长效干扰素。如果经济条件不好，可以选用普通α干扰素、复合干扰素。
2、干扰素治疗一旦获得早期应答，就应该认真坚持治疗。对于丙肝病毒基因分型为l型者，治疗需要坚持一年以上时间。使用干扰素治疗要强调早期应答，即治疗3个月时病毒定量应该明显下降；如果不下降，应考虑加大药物剂量，例如普通α干扰素由300万单位／次增加到500万－600万单位／次，或是变换干扰素种类。同时要有充足的疗程，干扰素治疗一旦奏效，就应该坚持1年以上时间。
3、一定要选择合适的适应症。专家们建议，丙肝的肝纤维化F2期和F3期是抗病毒(干扰素)治疗的最佳适应症，肝硬化早期可考虑抗病毒治疗。丙肝病毒基因型与抗病毒治疗也有关系。所以，慢性丙肝病人应争取进行肝活检和丙肝病毒基因型及病毒载量的测定，为治疗提供可靠的依据。
4、联合用药。目前推荐的方案是干扰素联合病毒唑(利巴韦林)，还可应用干扰素联合胸腺肽(Tαl)，后者每次1.6毫克皮下注射，每周应用2-3次。新近研究，国产中药氧化苦参碱注射剂除有抗乙肝病毒作用外，还有抗丙肝病毒作用，有人应用于临床，每次200毫克肌注，每日2次，疗效很好，不逊于干扰素。可和干扰素联合应用治疗丙肝。
5、疗效判定不能完全以转氨酶为标准，主要应以丙肝病毒RNA来验证。如果丙肝病毒RNA转阴，说明治疗的效果好；如治疗结束后2年，丙肝病毒RNA仍为阴性，这叫“持续-应答”，最理想。有的患者以抗HCV的阳性或阴性来判断干扰素疗效，这是不对的。
目前治疗丙肝，即便是正确使用了以上所说的方法，也并非100％的患者都可能取得理想的效果。治疗效果的好坏还取决于一些无法干预的因素，例如丙肝病毒的基因分型。一般来说，丙肝病毒基因分型为2型、3型者，治疗效果要好于1型。我国丙肝病例多由输血等医疗原因所致，病毒基因分型多为1型，疗效相对较差。另外，丙肝治疗效果还与患者的体重、合并疾病等因素有关。如果丙肝合并肝硬化、脂肪肝、糖尿病、心脏病、胆道感染、HIV感染等，对于合并症也应适当治疗，否则不会收到满意效果。还有研究发现，许多难治性丙肝病人血清铁较高，肝细胞内含铁也多，影响疗效。有人给丙肝患者应用乳铁蛋白，使其结合过多的铁，排出体外。乳铁蛋白是一种转铁蛋白，同时有免疫调节作用。
