2018年贵州省南北部地区艾滋病感染者抗病毒治疗前HIV-1基因亚型和耐药情况研究

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方星 张信辉 邢辉 杨晓慧 赵明伍 柳兴凤

(1.贵州省疾病预防控制中心/实验中心,贵州 贵阳 550004;
2.中国疾病预防控制中心/性病艾滋病预防控制中心,北京 102206;
3.黔南州疾病预防控制中心,贵州 都匀 558000;
4.遵义市疾病预防控制中心,贵州 遵义 563000;
5.遵义医科大学/贵州省普通高等学校脑科学特色重点实验室,贵州 遵义 563000)

全球扩大抗逆转录病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)通过有效抑制 HIV 感染者体内病毒的复制导致HIV-1 发病率和病死率大幅下降,使艾滋病成为慢性可治疗的疾病[1-2]。随着我国艾滋病ART工作的快速推广和ART人数的增长,以及药物的有限选择下,HIV耐药株的问题已经日益凸显,特别是在贵州省长期实施ART后,ART前的原发耐药值得关注。而我省之前主要关注治疗后的获得性耐药,所以本研究对2018年1—12月贵州省南北部地区(黔南州、遵义市)ART前388名新发现的HIV感染者进行耐药检测,对其HIV-1耐药基因型和耐药株的流行水平进行分析,为控制HIV耐药株的流行提供参考依据。

1.1研究对象 2018年贵州省南北部地区(黔南州、遵义市)1—12月开始抗病毒治疗前、年龄≥18岁的新发现HIV感染者,在提供书面知情同意书后,按初始的ART时间先后顺序入组,收集流行病学资料,并采集ART前的抗凝静脉血并分离血浆,运送到贵州省艾滋病确证中心实验室。

1.2检测方法 采用in-house方法进行耐药检测。使用 MagNA Pure LC 全自动核酸提取仪和 MagNA Pure LC Total Nucleic Acid Isolation Kit(德国,Roche)提取血浆RNA。用 One Step RNA PCR Kit(AMV)(日本,Takara)和引物 MAW26、RT21(北京,天一辉远)进行逆转录和巢式PCR 扩增pol基因区,引物序列见表1。琼脂糖凝胶电泳鉴定目的片段1.3kb后,送北京天一辉远生物科技有限公司进行PCR 产物纯化、测序、序列拼接和校对。

表1 耐药基因检测引物序列

1.3基因型、耐药程度分析 将得到包括蛋白酶区1~99氨基酸和逆转录酶区1~300氨基酸的pol基因区序列,提交美国斯坦福大学的网络HIV数据库进行基因型分析、耐药性突变位点分析和对各种抗病毒药物的耐受程度分析,对任何一种药物出现低度及以上耐药即判断为基因型耐药。

2.1调查对象的基本特征 共调查2018年1—12月贵州省南北部黔南州和遵义市抗病毒治疗前、年龄≥18岁的新发现HIV感染者388例,并采集抗凝血样。经提取、扩增和测序,获得341例pol区基因片段。其中,纳入对象性别比为234/107(男/女),年龄18~83岁,平均(48.94±14.96)岁,汉族与少数民族比例为 237/104。调查时CD4+T淋巴细胞≤200个/μL占30.5%(104/341),201~350个/μL占25.81%(88/341),351~500个/μL占15.54%(53/341),>500个/μL占6.61%(21/341),缺失CD4+T淋巴细胞的占21.99%(75/341)。病毒载量检测比例为61.58%(210/341),病毒载量≤1 000 copies/mL占1.17%(4/341),1 001~100 000 copies/mL占31.09%(106/341),>100 000 copies/mL占29.33%(100/341)。婚姻状况,未婚者占16.42%(56/341),已婚或同居者占50.15%(171/341),离婚或丧偶者占31.67%(108/341)。传播途径以异性传播为主(94.43%,322/388),同性传播占3.81%(13/341)。见表2。

表2 341例获得pol区基因片段HIV感染者的基本情况[n(%)]

2.2研究对象HIV-1基因亚型的分布情况 在得到的341份pol区基因片段中,发现8种HIV-1基因型,其中占比最多的基因型是CRF01_AE(54.55%,186/341),其次为CRF07_BC(27.57%,94/341)和CRF08_BC (12.90%,44/341),其他亚型还包括CRF55_01B以及A、B、C、D亚型。

2.3研究对象HIV-1耐药发生情况 发现耐药突变的比例为12.02%(41/341),包括NRTIs耐药突变1.76%(6/341),ABC、FTC、3TC耐药分别达0.88%(3/341),HIV耐药突变位点;
NNRTIs相关耐药突变9.68%(33/341),其中,EFV耐药占7.33%(25/341)、NVP耐药占9.09%(31/341);
PIs耐药突变占1.17%(4/341),HIV耐药突变位点。发生NRTIs和NNRTIs、NNRTIs和PIs交叉耐药分别占0.29%(1/341)。耐药基因突变主要与非核苷反转录酶抑制剂 (NNRTIs)(33/341,9.68%)有关。V179(18/341,5.28%)是其中较突出的突变位点,其次为V106(7/341,2.05%)、E138(6/341,1.76%)。见表3。

表3 41例HIV-1感染者耐药特征分析

HIV耐药株的出现使感染者ART的效果下降,同时耐药株在未治疗人群中的传播和流行也给ART的长期实施增加障碍。本研究对2018年1—12月贵州省南北部地区(黔南州、遵义市)ART前388名新发现的HIV感染者进行耐药检测,对得到的341份pol区基因片段的HIV-1耐药基因型和耐药突变的流行水平进行分析研究。

在亚型的分布上,贵州省HIV以CRF01_AE为主,占54.55%,其次为CRF07_BC和CRF08_BC,也有多种其他亚型(CRF55_01B以及A、B、C、D亚型并存),这与柳兴凤等人的2013-2017年贵州省艾滋病患者HIV亚型分布研究[3]结果一致,也与我省以性传播流行毒株亚型相符合[3-4]。

贵州省2009年及2015年的HIV耐药警戒线调查显示耐药率分别为0、3.5%,均小于5%,为低流行水平[5-6]。而此次调查发现HIV耐药株的比例为12.02%,根据WHO耐药监测指南的标准,已达到中度耐药水平,耐药为单重耐药与多重耐药并存,并且已发现有PI类药物的原发耐药,类型复杂多样,因此应重点关注当地HIV耐药株的流行,这可能与扩大ART的覆盖面积产生的耐药株有关。耐药基因突变主要与非核苷反转录酶抑制剂(NNRTIs)有关,V179是NNRTIs出现最多的突变位点,其次为V106、E138,这与目前使用一线的ART方案实施情况相符。

综上所述,HIV耐药株在贵州省南北部地区新发现的艾滋病感染者中出现中度流行,类型复杂,因此应适时在省内全面开展治疗前的耐药监测,以减少原发耐药毒株的产生和传播。

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